בית משפט פקיסטני זימן את ראשי כל הממשלות הקודמות והנוכחיות, כולל המושל הצבאי לשעבר, פרבז מושארף, הגולה והחולה, כדי להסביר מדוע אלפי אזרחים "נעלמים" ומוכרזים "נעדרים" כחלק מ"מדיניות המדינה".
עם זאת, בית המשפט העליון של איסלמבאד הוציא באופן ספציפי את הצבא ואת סוכנויותיו. גם הם מואשמים בהרחבה באחריות ל"היעלמותם" של כ-5.000-8.000 איש.
בית המשפט הוציא את הצבא מזימונים, וציין זאת "המעורבות או אפילו התפיסה של מעורבות הכוחות המזוינים במעשים המהווים הפרה של זכויות האדם וחירותם של האזרחים מחלישה ומערערת את שלטון החוק".
ארגוני זכויות אדם, הן בפקיסטן והן מחוצה לה, לא עשו הבחנה זו והצביעו, במישרין או אחרת, על מעורבות של סוכנויות מודיעין צבאיות ואזרחיות.
הנחיה מבית משפט בראשותו של השופט אתר מינאלה הגיעה ב-30 במאי, בעקבות האשמות של שרת זכויות האדם לשעבר, שירין מזארי, על כך שהוזמנה על ידי זרוע המודיעין החזקה של הצבא הפקיסטני,מודיעין בין שירותים (ISI), ביחס לפעולה של ממשלתו באנשים "נעדרים".
מזארי, מנתח אבטחה, היה בממשלתו של עמראן חאן, שנבחר בחודש שעבר. כמו חאן, הוא מתח ביקורת על תפקידו כביכול של הצבא במהומה הפוליטית המתמשכת.
בהערותיו הורה בית המשפט למצוא את כל "הנעדרים" ולהציג אותם בפני בית המשפט ב-17 ביוני אשתקד; אחרת, ראשי הממשלה ושרי הפנים, בעבר ובהווה, יצטרכו להישלח למשפט.
בעוד שמושארף נקרא בפקודה, שאר ה"מנהיגים" לשעבר - ראשי ממשלה ושרי פנים, בעבר ובהווה - הודחו מהרשימה.
"זה תלוי בכל ראש ההנהלה להפריך את ההנחה ולהסביר מדוע לא ניתן להעמידו לדין על פשע בגידה גבוה", אמר השופט בצו.
באשר למושארף, המתגורר שנים רבות בדובאי, הוא לא הגיב למספר זימונים לבית המשפט, שקבע כי: "פרבז מושארף הודה בגילוי לב באוטוביוגרפיה שלו בקו האש ש'היעלמויות כפויות' הן מדיניות לא מוצהרת של המדינה"..
סוגיית ה"היעלמות" של מספר רב של אנשים החלה ב-1999 והסלימה בעקבות ה-11 בספטמבר ותפקידה של פקיסטן ב"מלחמה בטרור" בראשות ארה"ב באפגניסטן.
עצורים רבים, גולים או חשודים כי הגיעו לבתי הכלא האמריקאים במפרץ גואנטנמו, קובה, הוצבו ברשימת "נעדרים" או "נעדרים" ומשפחותיהם סוערות מזה זמן מה.
בית המשפט העליון של פקיסטן, כמו גם בתי משפט אחרים, והשופט מינאלה עצמו, הוציאו צווים לדרוש לחלץ נעדרים ולהחזיר אותם למשפחותיהם. בשנה שעברה הורתה מינאלה לפצות משפחות על ידי הממשלה המכהנת.
משערים שהמשימה החדשה של ה-ISI היא להביא ל"כניעה" רשמית של שריף (ראש ממשלת פקיסטן הנוכחי) למנהיגים החזקים של הצבא, או שזו יכולה להיות רק דרך חכמה לזוז הצידה ולתת להם להיות. לעשות את העבודה הקשה, באמצעות ממשלת ביניים עד שיתקיימו בחירות. אבל זה יותר שאלה של סמנטיקה מאשר של השלכות פוליטיות רחבות יותר. לפי אנליסטים, הפוליטיקה היא המפסידה נטו בשני המצבים.
התפקיד החדש של ה-ISI מגיע לאחר שהארגון יצא ממחלוקת בין אימראן חאן לבאג'ווה שנתפסה כאחת הסיבות לכך שהצבא הפך ל"נייטרלי" ואיפשר להעמיד את חאן להצבעה באסיפה הלאומית. חאן רצה להשאיר את לוטננט גנרל פאיז חמיד כראש ה-ISI, בעוד בג'ווה רצה להזיז אותו. בג'ווה ניצח, אבל חמיד נשאר קצין בכיר רב עוצמה ב-ISI כאשר בג'ווה עצמו מסיים את כהונתו בנובמבר.
פקיסטן עשויה להיות היחידה שמאפשרת לסוכנות מודיעין צבאית לפקח על גיוס ומינוי של פקידים אזרחיים בתפקידי מפתח ממשלתיים. זה מרחיב רשמית את תפקידו של הצבא במגזר האזרחי ויכול לגרום לכך שעוד קצינים יגוייסו למלא תפקידים אזרחיים מרכזיים. כפי שהוא, הצבא מפקח באופן רשמי על עניינים כמו היחסים עם הודו, סוגיית קשמיר, היחסים עם ארצות הברית, סין ותוכניות גרעין.
התהליך הפרלמנטרי שהוביל אותו להתמודד עם הצעת אי אמון פנה כעת גם נגד ממשלת סבהבז שריף.
ב-6 ביוני, שריף ובנו חמזה, ראש ממשלת מחוז פנג'אב, הופיעו בבית המשפט כדי להימנע ממעצר בתיק באשמת אי סדרים פיננסיים ושחיתות. כל זה הופך את ממשלת איסלמבאד לחלשה ביותר.
