התקופה הארוכה שהשקיעו היחידה בברזיל כמעט לא נפגעה מזיהומים, שכן רק מקרה אחד של קדחת צהובה עלה על הסיפון, אבל בשפך ריו דה לה פלאטה היו ארבעה מקרים של כולרה, שניים מהם קטלניים.
הגדול היה הקורבנות של האנשים שהתחילו על תנאי החיים ההיגייניים המסוכנים החמורים במיוחד באקלים לא בריא וחשופים למחלות זיהומיות במגעים עם האוכלוסיות המקומיות: הנתונים הסטטיסטיים של הסניטיה גינו כי התמותה (למעט תאונות עבודה והפסדים בלחימה) בדרך כלל בשנים אלה לא יעלה על 3 לאלף כוח הכולל של חיל הים (דמות כבר גבוה להפליא בהשוואה להיום) כתוצאה מהאירועים בברזיל, עלה 9,75 לאלף.
מקור: חיל הים
